中身が空になってしまう理由がいくつか考えられます。

１．ウイルス対策ソフトの誤検知により、ファイルの中身が削除された。

→ ウイルス対策ソフトを一時的に停止してダウンロード・解凍してみてください。

２．解凍ソフトの不具合

→ 別の解凍ソフトで解凍できるかお試しください。

３．ZIP ファイルの関連付けがおかしくなっている。

４．ファイルが「隠し属性」になっている。